马云持有公司8.9%的股份，为最大个人股东。日本电信企业软银公司持有阿里巴巴34.4%的股份，为最大股东。此外，雅虎持股22.6%，阿里巴巴联合创始人蔡崇信持股3.6%。

软银持有阿里巴巴股权29.2%，雅虎持有阿里巴巴股权15%，马云持有阿里股权7%。